新冠病毒傳播初期已高度適應(yīng)人類 需高度警惕二次暴發(fā)

　　新冠病毒高度適應(yīng)于人類，需高度警惕二次暴發(fā)

　　對(duì)于新冠病毒而言，研發(fā)特定的抗病毒藥物、抗體或疫苗所用的時(shí)間長(zhǎng)短取決于病毒基因或蛋白質(zhì)的進(jìn)化速度和傳播程度。

　　日前，包括鐘南山院士在內(nèi)的多個(gè)專家團(tuán)隊(duì)已經(jīng)指出，新冠病毒在傳播過(guò)程中發(fā)生了廣泛的變異，現(xiàn)在已經(jīng)非常適應(yīng)在人體內(nèi)生存。之前的一些醫(yī)學(xué)報(bào)告指出，SARS-CoV-2基因組似乎穩(wěn)定下來(lái)，其在人體的適應(yīng)壓力不大，這對(duì)診斷、疫苗和治療學(xué)的發(fā)展都是好兆頭。

　　為了更好地了解SARS-CoV-2基因組的穩(wěn)定性，研究人員對(duì)SARS-CoV-2和SARS-CoV之間的進(jìn)化動(dòng)力學(xué)進(jìn)行了并行比較。

　　研究人員收集了11個(gè)SARS-CoV流行早期至中期的基因組，32個(gè)SARS-CoV流行晚期的基因組以及46個(gè)SARS-CoV-2基因組。

　　令人驚訝的是，與SARS-CoV相比，SARS-CoV-2表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性，而SARS-CoV在其流行的早期到中期具有相當(dāng)大的遺傳多樣性。相比之下，SARS-CoV-2的遺傳多樣性與晚期流行SARS-CoV的遺傳多樣性更為相似。

　　SARS-CoV和SARS-CoV-2遺傳差異的比較，在同樣的時(shí)間范圍內(nèi)，SARS-CoV-2（紅色）的遺傳多樣性比早期到中期SARS-CoV（藍(lán)色）的少

　　此前對(duì)SARS-CoV的研究表明，在早期和中期傳播階段，SARS-CoV受到的選擇壓力（又稱為進(jìn)化壓力，指外界施與一個(gè)生物進(jìn)化過(guò)程的壓力）最大，并在流行晚期時(shí)選擇壓力減弱。在從蝙蝠、果子貍傳播到人類以及接下來(lái)的人際傳播的過(guò)程中，一系列適應(yīng)活動(dòng)使病毒具有高度傳染性，這一高傳染性主導(dǎo)了其晚期流行階段。

　　非同義和同義替代率（dN和dS）通常用于模擬病毒S蛋白（在病毒入侵人體時(shí)與宿主受體結(jié)合并影響宿主特異性）等基因經(jīng)歷的選擇壓力。研究人員在2020年1月、2月和3月每個(gè)月從不同的地理位置采樣50個(gè)SARS-CoV-2基因組，他們發(fā)現(xiàn)對(duì)于病毒S蛋白、Orf3a和Orf1a基因而言，新冠病毒中的dN和dS與SARS-CoV晚期流行時(shí)的情況更相似。