新冠病毒傳播初期已高度適應(yīng)人類(lèi) 需高度警惕二次暴發(fā)
新冠病毒高度適應(yīng)于人類(lèi),需高度警惕二次暴發(fā)
對(duì)于新冠病毒而言,研發(fā)特定的抗病毒藥物、抗體或疫苗所用的時(shí)間長(zhǎng)短取決于病毒基因或蛋白質(zhì)的進(jìn)化速度和傳播程度。
日前,包括鐘南山院士在內(nèi)的多個(gè)專(zhuān)家團(tuán)隊(duì)已經(jīng)指出,新冠病毒在傳播過(guò)程中發(fā)生了廣泛的變異,現(xiàn)在已經(jīng)非常適應(yīng)在人體內(nèi)生存。之前的一些醫(yī)學(xué)報(bào)告指出,SARS-CoV-2基因組似乎穩(wěn)定下來(lái),其在人體的適應(yīng)壓力不大,這對(duì)診斷、疫苗和治療學(xué)的發(fā)展都是好兆頭。
為了更好地了解SARS-CoV-2基因組的穩(wěn)定性,研究人員對(duì)SARS-CoV-2和SARS-CoV之間的進(jìn)化動(dòng)力學(xué)進(jìn)行了并行比較。
研究人員收集了11個(gè)SARS-CoV流行早期至中期的基因組,32個(gè)SARS-CoV流行晚期的基因組以及46個(gè)SARS-CoV-2基因組。
令人驚訝的是,與SARS-CoV相比,SARS-CoV-2表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性,而SARS-CoV在其流行的早期到中期具有相當(dāng)大的遺傳多樣性。相比之下,SARS-CoV-2的遺傳多樣性與晚期流行SARS-CoV的遺傳多樣性更為相似。
SARS-CoV和SARS-CoV-2遺傳差異的比較,在同樣的時(shí)間范圍內(nèi),SARS-CoV-2(紅色)的遺傳多樣性比早期到中期SARS-CoV(藍(lán)色)的少
此前對(duì)SARS-CoV的研究表明,在早期和中期傳播階段,SARS-CoV受到的選擇壓力(又稱(chēng)為進(jìn)化壓力,指外界施與一個(gè)生物進(jìn)化過(guò)程的壓力)最大,并在流行晚期時(shí)選擇壓力減弱。在從蝙蝠、果子貍傳播到人類(lèi)以及接下來(lái)的人際傳播的過(guò)程中,一系列適應(yīng)活動(dòng)使病毒具有高度傳染性,這一高傳染性主導(dǎo)了其晚期流行階段。
非同義和同義替代率(dN和dS)通常用于模擬病毒S蛋白(在病毒入侵人體時(shí)與宿主受體結(jié)合并影響宿主特異性)等基因經(jīng)歷的選擇壓力。研究人員在2020年1月、2月和3月每個(gè)月從不同的地理位置采樣50個(gè)SARS-CoV-2基因組,他們發(fā)現(xiàn)對(duì)于病毒S蛋白、Orf3a和Orf1a基因而言,新冠病毒中的dN和dS與SARS-CoV晚期流行時(shí)的情況更相似。