新冠病毒高度適應(yīng)人類 病毒二次爆發(fā)可能性很大

　　作者們還強調(diào)，新冠病毒的S蛋白（刺突糖蛋白）有可能在蝙蝠或多種中間宿主中自然進化出其廣泛的物種向性（species tropism），即它可能與多物種的受體結(jié)合。

　　對此，研究人員提出建議，應(yīng)擴大采樣范圍，從市場、農(nóng)場和野生動物中收集SARS-CoV-2樣病毒。此外，應(yīng)該檢查2019年底前幾個月的人類樣本中SARS-CoV-2樣病毒或SARS-CoV-2反應(yīng)抗體，以檢測病毒在人類社會中流行的前體。

　　新冠病毒高度適應(yīng)于人類，需高度警惕二次暴發(fā)

　　對于新冠病毒而言，研發(fā)特定的抗病毒藥物、抗體或疫苗所用的時間長短取決于病毒基因或蛋白質(zhì)的進化速度和傳播程度。

　　日前，包括鐘南山院士在內(nèi)的多個專家團隊已經(jīng)指出，新冠病毒在傳播過程中發(fā)生了廣泛的變異，現(xiàn)在已經(jīng)非常適應(yīng)在人體內(nèi)生存。之前的一些醫(yī)學(xué)報告指出，SARS-CoV-2基因組似乎穩(wěn)定下來，其在人體的適應(yīng)壓力不大，這對診斷、疫苗和治療學(xué)的發(fā)展都是好兆頭。

　　為了更好地了解SARS-CoV-2基因組的穩(wěn)定性，研究人員對SARS-CoV-2和SARS-CoV之間的進化動力學(xué)進行了并行比較。

　　研究人員收集了11個SARS-CoV流行早期至中期的基因組，32個SARS-CoV流行晚期的基因組以及46個SARS-CoV-2基因組。

　　令人驚訝的是，與SARS-CoV相比，SARS-CoV-2表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性，而SARS-CoV在其流行的早期到中期具有相當(dāng)大的遺傳多樣性。相比之下，SARS-CoV-2的遺傳多樣性與晚期流行SARS-CoV的遺傳多樣性更為相似。

　　SARS-CoV和SARS-CoV-2遺傳差異的比較，在同樣的時間范圍內(nèi)，SARS-CoV-2（紅色）的遺傳多樣性比早期到中期SARS-CoV（藍(lán)色）的少。

　　此前對SARS-CoV的研究表明，在早期和中期傳播階段，SARS-CoV受到的選擇壓力（又稱為進化壓力，指外界施與一個生物進化過程的壓力）最大，并在流行晚期時選擇壓力減弱。在從蝙蝠、果子貍傳播到人類以及接下來的人際傳播的過程中，一系列適應(yīng)活動使病毒具有高度傳染性，這一高傳染性主導(dǎo)了其晚期流行階段。

　　非同義和同義替代率（dN和dS）通常用于模擬病毒S蛋白（在病毒入侵人體時與宿主受體結(jié)合并影響宿主特異性）等基因經(jīng)歷的選擇壓力。研究人員在2020年1月、2月和3月每個月從不同的地理位置采樣50個SARS-CoV-2基因組，他們發(fā)現(xiàn)對于病毒S蛋白、Orf3a和Orf1a基因而言，新冠病毒中的dN和dS與SARS-CoV晚期流行時的情況更相似。

　　流行早期至中期的SARS-CoV、流行晚期的SARS-CoV以及2020年1月至3月的SARS-CoV-2樣本中S蛋白等基因的dN和dS對比情況。這些研究結(jié)果意味著，SARS-CoV-2在暴發(fā)之初就已經(jīng)高度適應(yīng)于人類，并表現(xiàn)出極強的傳播能力。

　　研究人員還表示，在人類和動物中，一種更早期的、適應(yīng)性較差的共同祖病毒尚未被找到，其前體或分支也是缺失的。這表明該病毒以一種高人類適應(yīng)性的形式進入人類社會，這也意味著在不久的將來再次出現(xiàn)SARS-CoV-2的風(fēng)險較高，且其后果可能較嚴(yán)重。

　　自然界進化可能使新冠病毒與多物種結(jié)合，應(yīng)擴大采樣范圍

　　迄今為止，研究人員仍不確定新冠病毒的中間宿主是什么。此前的研究發(fā)現(xiàn)，與SARS-CoV-2關(guān)系最密切的冠狀病毒是蝙蝠冠狀病毒RaTG13，而從馬來西亞穿山甲中分離出的一種冠狀病毒的遺傳序列與SARS-CoV-2有高達(dá)91%的同源性，因此，研究人員認(rèn)為，就目前而言，蝙蝠是新冠病毒起源、穿山甲是中間宿主的可能性較大。

　　此外，研究人員指出，新冠病毒的S蛋白有可能在蝙蝠或多種中間宿主中自然進化出其廣泛的物種向性，即它可能與多物種的受體結(jié)合。

　　此前有研究預(yù)測，SARS-CoV-2的S蛋白可能與100多種不同物種的ACE2（血管緊張素轉(zhuǎn)化酶2，新冠病毒的人類受體）結(jié)合，并且比SARS-CoV對于蝙蝠和人類ACE2的結(jié)合性都強。

　　因此，盡管尚未發(fā)現(xiàn)蝙蝠冠狀病毒具有SARS-CoV-2樣的S蛋白RBD（受體結(jié)合域），但新冠病毒很可能在自然界中進化，并且可以以最佳水平與不同物種的同一受體結(jié)合。研究人員建議，

　　應(yīng)從更多物種中進行冠狀病毒采樣，從而更好地掌握攜帶與SARS-CoV-2相似的RBD的冠狀病毒的物種范圍，明確其中間宿主。

　　為了尋找有關(guān)新冠病毒中間宿主的線索，研究人員還分析了有關(guān)SARS-CoV-2如何進化和適應(yīng)人類傳播的最新發(fā)現(xiàn)，并研究了武漢華南海鮮市場的環(huán)境樣本。

　　結(jié)果表明，2020年1月份在市場發(fā)現(xiàn)的病毒分離株不太可能起源于中間動物宿主，而是最有可能來自被SARS-CoV-2感染的人，他們可能是市場里的賣家或顧客。

　　為了追蹤新冠病毒祖先病毒株，找出其中間宿主，研究人員提出了以下建議：

　　1、從市場、農(nóng)場和野生動物中收集SARS-CoV-2樣病毒；

　　2、檢查2019年底前幾個月的人類樣本中SARS-CoV-2樣病毒或SARS-CoV-2反應(yīng)抗體，以檢測病毒在人類社會流行的前體；

　　3、對更多早期的SARS-CoV-2分離株進行測序，特別是早期分離株，可以識別出人類適應(yīng)性較弱的祖細(xì)胞的分支；

　　4、評估食品經(jīng)營者和動物貿(mào)易商的患病率相較普通人是否過高，以確定動物貿(mào)易中是否存在SARS-CoV-2祖先病毒株；

　　此外，應(yīng)更廣泛地限制人類活動，減少人類與野生動物及其棲息地的頻繁或長期接觸。