云南發(fā)現(xiàn)一種新蝙蝠冠狀病毒 提示新冠病毒自然界重組線索

　　系統(tǒng)發(fā)育樹：a 全長(zhǎng)基因組;b、S基因;c、RBD ;d、RdRp(RNA依賴的RNA聚合酶)。

　　研究團(tuán)隊(duì)還對(duì)RmYN02、RaTG13、HCoV-19和穿山甲中的蝙蝠冠狀病毒進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育分析。與先前的研究相符，穿山甲beta-CoVs形成兩個(gè)亞型。然而，論文中提到，穿山甲是否是這些病毒的天然蓄水池，或者它們從蝙蝠或其他野生動(dòng)物中獨(dú)立獲得，這都需要進(jìn)一步驗(yàn)證。

　　更值得注意的是，在大多數(shù)病毒基因組中，RmYN02與HCoV-19的親緣關(guān)系最近，盡管這兩種病毒之間仍然有一段較長(zhǎng)的分支距離。S基因樹顯示，HCoV-19離RaTG13較近，和RmYN02較遠(yuǎn)，這表明后者在S基因經(jīng)歷了重組。在RBD的系統(tǒng)發(fā)育樹上，HCoV-19和pangolin-CoV/GD最密切相關(guān)，與蝙蝠病毒都較遠(yuǎn)，再次表明重組發(fā)生。最后，完整的RNA依賴的RNA聚合酶(RdRp)基因(在RNA病毒的系統(tǒng)發(fā)育分析中經(jīng)常被使用)系統(tǒng)發(fā)育分析顯示，RmYN02、RaTG13和HCoV-19形成了一個(gè)與穿山甲病毒完全不同的亞群。